琴江村始建于清雍正七年（1729年），原是清朝“三江口水师旗营”琴江满族村，这个村落也是福建省唯一一个满族聚居村。琴江村位于闽江下游南岸，因流经这一段的闽江宛如一把古琴，故名琴江。村落地理区位优越，水陆交通方便，自然和人文景观资源丰富，1999年被省政府授予首批“历史文化名村”，2007年被评为“福建最美乡村”，2010年荣获“中国历史文化名村”称号。

琴江原本只是一个渡口，雍正六年（公元1728年），朝廷为加强边防镇守，从老四旗中抽调513名官兵进驻琴江，围地筑城，建立闽江口水师旗营，为当时全国沿海四大水师旗营之一，比马尾的福建水师还早151年，并且琴江水师旗营也是全国四大水师旗营中保留最为完整的一个。

村庄最初仅一面筑墙，乾隆五年（1740年）又增建三面城墙。城墙周长约1000米，高3米，宽1米，有东、西、南、北4个城门进出。内建有将军行辕等12座衙门，首里街、大街等12条街巷。

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在清代，凡是有旗人驻扎的地方都设有围墙，平时城墙内的人不得随便出城，城内人不得与外面的人通婚，事实上，这应该算得上一个封闭的社会，所以学术界把围墙内的营盘称为“满城”，八旗驻防的旗兵都是携带家眷的，家眷随军驻扎，所以旗营内既有兵，也有民，他们都是旗人。